Влияние pH на конформацию модифицированного аптамера к белку нуклеолину

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Поиск агентов для адресной доставки противораковых препаратов остается крайне востребованной для медицины задачей. В этой связи находят свое применение ДНК-аптамеры к белкам, специфичным к раковым клеткам. Вместе с тем дополнительная настройка активности аптамеров для снижения их аффинности к мишеням вне раковых тканей может улучшить перспективы их клинического применения ввиду сокращения иммуногенности и количества побочных эффектов. Одним из подходов является использование нарушения кислотности в раковых клетках и тканях. В данной работе мы модифицировали аптамер AS1411 к нуклеолину путем присоединения к нему нуклеотидной последовательности, сообщающей аптамеру свойство pH-чувствительности. Методами спектрофотометрического плавления и флуоресценции было продемонстрировано, что конформация нового аптамера обусловлена pH среды.

Об авторах

П. В Габрусенок

Санкт-Петербургский государственный университет

Санкт-Петербург, Россия

Р. Р Рамазанов

Севастопольский государственный университет

Севастополь, Россия

А. С Бучельников

Севастопольский государственный университет

Севастополь, Россия

П. А Соколов

Санкт-Петербургский государственный университет;Севастопольский государственный университет

Email: p.a.sokolov@spbu.ru
Санкт-Петербург, Россия;Севастополь, Россия

Список литературы

  1. F. Mongelard and P. Bouvet, Trends Cell Biol., 17 (2), 80 (2007).
  2. S. Christian, J. Pilch, M. E. Akerman, et al., J. Cell Biol., 163 (4), 871 (2003).
  3. J. Mosafer and A. Mokhtarzadeh, Curr. Drug Delivery, 15 (9), 1323 (2018).
  4. C. Brignole, V. Bensa, N. A. Fonseca, et al., J. Exp. Clin. Cancer Res., 40 (1), 180 (2021).
  5. J. BalQa-Silva, A. do Carmo, H. Tao, et al., Exp. Cell Res., 370 (1), 68 (2018).
  6. V. Moura, M. Lacerda, P. Figueiredo, et al., Breast Cancer Res. Treat., 133 (1), 61 (2012).
  7. J. Carvalho, A. Paiva, M. P. Cabral Campello, et al., Sci. Rep., 9 (1), 7945 (2019).
  8. N. F. Hosseini, R. Amini, M. Ramezani, et al., Biomed. Pharmacother., 155, 113690 (2022).
  9. С. П. Радько, С. Ю. Рахметова, Н. В. Бодоев и др., Биомед. химия, 53 (1), 5 (2007).
  10. С. А. Лапа, В. Е. Шершов, Г. С. Краснов и др., Биоорг. химия, 46 (4), 411 (2020).
  11. Z. Fu and J. Xiang, Int. J. Mol. Sci., 21 (8), 2793 (2020).
  12. R. Yazdian-Robati, P. Bayat, F. Oroojalian, et al., Int. J. Biol. Macromol., 155, 1420 (2020).
  13. B. A. Webb, M. Chimenti, M. P. Jacobson, et al., Nat. Rev. Cancer, 11 (9), 671 (2011).
  14. M. Damaghi, J. W. Wojtkowiak, and R. J. Gillies, Front. Physiol. 4, 370 (2013).
  15. I. A. P. Thompson, L. Zheng, M. Eisenstein, et al., Nat.Commun., 11 (1), 2946 (2020).
  16. M. Debiais, A. Lelievre, M. Smietana, et al., Nucl. Acids Res., 48 (7), 3400 (2020).
  17. https://eu.idtdna.com/calc/analyzer.
  18. P. A. Rachwal and K. R. Fox, Methods, 43 (4), 291 (2007).
  19. J. A. Lee and M. C. DeRosa, Chem.Commun., 46 (3), 418 (2010).
  20. L. Bie, Y. Wang, F. Jiang, et al., Front. Mol. Biosci., 9, 1025313 (2022).
  21. F. C. Simmel, B. Yurke, and H. R. Singh, Chem. Rev., 119 (10), 6326 (2019).
  22. S. E. Morse and D. E. Draper, Nucl. Acids Res., 23 (2), 302 (1995).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2023